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信控学院博士生王纯纯在生物通路靶向药物治疗方面取得进展

基于贝叶斯稀疏因子预测模型流程图

基于多特征融合预测模型流程图

传统的药物研发遵循一种药物对应一个靶点的策略,而疾病的发生通常是由于系统水平上的异常。因此,人们提出基于系统生物学的思想进行药物研发,基于生物通路的药物研发策略正是这种思想的重要体现。识别药物和通路之间的关联是基于通路进行药物研发的重要一步。信控学院2019级博士研究生王纯纯在生物通路靶向药物治疗方面取得进展,成果形成学术论文“Drug-pathway association prediction: from experimental results to computational models”。

论文介绍了药物研发的背景以及药物和生物通路关联的概念,介绍了一些在药物和生物通路关联预测领域常用的数据库,系统地分析了近几年药物和生物通路关联预测的计算模型,并把它们分为三类:基于贝叶斯稀疏因子、基于矩阵分解和基于其他机器学习算法的模型。此外,论文梳理了几种用于评估计算模型预测性能的方法,讨论了现有计算模型存在的优点和局限性,并对数据收集和计算模型的未来发展方向提供了一些建议。


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